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1.

Underdetected dispersal and extensive local transmission drove the 2022 mpox epidemic.

Paredes, Miguel I; Ahmed, Nashwa; Figgins, Marlin; Colizza, Vittoria; Lemey, Philippe; McCrone, John T; Müller, Nicola; Tran-Kiem, Cécile; Bedford, Trevor.

Cell ; 187(6): 1374-1386.e13, 2024 Mar 14.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38428425

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10962340
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2024.02.003

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2.

Emergence of an early SARS-CoV-2 epidemic in the United States.

Zeller, Mark; Gangavarapu, Karthik; Anderson, Catelyn; Smither, Allison R; Vanchiere, John A; Rose, Rebecca; Snyder, Daniel J; Dudas, Gytis; Watts, Alexander; Matteson, Nathaniel L; Robles-Sikisaka, Refugio; Marshall, Maximilian; Feehan, Amy K; Sabino-Santos, Gilberto; Bell-Kareem, Antoinette R; Hughes, Laura D; Alkuzweny, Manar; Snarski, Patricia; Garcia-Diaz, Julia; Scott, Rona S; Melnik, Lilia I; Klitting, Raphaëlle; McGraw, Michelle; Belda-Ferre, Pedro; DeHoff, Peter; Sathe, Shashank; Marotz, Clarisse; Grubaugh, Nathan D; Nolan, David J; Drouin, Arnaud C; Genemaras, Kaylynn J; Chao, Karissa; Topol, Sarah; Spencer, Emily; Nicholson, Laura; Aigner, Stefan; Yeo, Gene W; Farnaes, Lauge; Hobbs, Charlotte A; Laurent, Louise C; Knight, Rob; Hodcroft, Emma B; Khan, Kamran; Fusco, Dahlene N; Cooper, Vaughn S; Lemey, Phillipe; Gardner, Lauren; Lamers, Susanna L; Kamil, Jeremy P; Garry, Robert F.

Cell ; 184(19): 4939-4952.e15, 2021 09 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34508652

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8313480
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.07.030

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3.

Infodemics: A new challenge for public health.

Briand, Sylvie C; Cinelli, Matteo; Nguyen, Tim; Lewis, Rosamund; Prybylski, Dimitri; Valensise, Carlo M; Colizza, Vittoria; Tozzi, Alberto Eugenio; Perra, Nicola; Baronchelli, Andrea; Tizzoni, Michele; Zollo, Fabiana; Scala, Antonio; Purnat, Tina; Czerniak, Christine; Kucharski, Adam J; Tshangela, Akhona; Zhou, Lei; Quattrociocchi, Walter.

Cell ; 184(25): 6010-6014, 2021 12 09.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34890548

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8656270
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2021.10.031

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4.

Travel Surveillance and Genomics Uncover a Hidden Zika Outbreak during the Waning Epidemic.

Grubaugh, Nathan D; Saraf, Sharada; Gangavarapu, Karthik; Watts, Alexander; Tan, Amanda L; Oidtman, Rachel J; Ladner, Jason T; Oliveira, Glenn; Matteson, Nathaniel L; Kraemer, Moritz U G; Vogels, Chantal B F; Hentoff, Aaron; Bhatia, Deepit; Stanek, Danielle; Scott, Blake; Landis, Vanessa; Stryker, Ian; Cone, Marshall R; Kopp, Edgar W; Cannons, Andrew C; Heberlein-Larson, Lea; White, Stephen; Gillis, Leah D; Ricciardi, Michael J; Kwal, Jaclyn; Lichtenberger, Paola K; Magnani, Diogo M; Watkins, David I; Palacios, Gustavo; Hamer, Davidson H; Gardner, Lauren M; Perkins, T Alex; Baele, Guy; Khan, Kamran; Morrison, Andrea; Isern, Sharon; Michael, Scott F; Andersen, Kristian G.

Cell ; 178(5): 1057-1071.e11, 2019 08 22.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-31442400

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6716374
https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2019.07.018

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5.

Macrophage expression and prognostic significance of the long pentraxin PTX3 in COVID-19.

Brunetta, Enrico; Folci, Marco; Bottazzi, Barbara; De Santis, Maria; Gritti, Giuseppe; Protti, Alessandro; Mapelli, Sarah N; Bonovas, Stefanos; Piovani, Daniele; Leone, Roberto; My, Ilaria; Zanon, Veronica; Spata, Gianmarco; Bacci, Monica; Supino, Domenico; Carnevale, Silvia; Sironi, Marina; Davoudian, Sadaf; Peano, Clelia; Landi, Francesco; Di Marco, Fabiano; Raimondi, Federico; Gianatti, Andrea; Angelini, Claudio; Rambaldi, Alessandro; Garlanda, Cecilia; Ciccarelli, Michele; Cecconi, Maurizio; Mantovani, Alberto.

Nat Immunol ; 22(1): 19-24, 2021 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33208929

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6.

Establishment of an African green monkey model for COVID-19 and protection against re-infection.

Woolsey, Courtney; Borisevich, Viktoriya; Prasad, Abhishek N; Agans, Krystle N; Deer, Daniel J; Dobias, Natalie S; Heymann, John C; Foster, Stephanie L; Levine, Corri B; Medina, Liana; Melody, Kevin; Geisbert, Joan B; Fenton, Karla A; Geisbert, Thomas W; Cross, Robert W.

Nat Immunol ; 22(1): 86-98, 2021 01.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-33235385

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7790436
https://dx.doi.org/10.1038/s41590-020-00835-8

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7.

Genomic Insights into Zika Virus Emergence and Spread.

Grubaugh, Nathan D; Faria, Nuno R; Andersen, Kristian G; Pybus, Oliver G.

Cell ; 172(6): 1160-1162, 2018 03 08.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-29522736

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8.

Transition to endemicity: Understanding COVID-19.

Antia, Rustom; Halloran, M Elizabeth.

Immunity ; 54(10): 2172-2176, 2021 Oct 12.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34626549

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8461290
https://dx.doi.org/10.1016/j.immuni.2021.09.019

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9.

Linking the allergy epidemic to climate change.

Rothenberg, Marc E.

Nat Immunol ; 23(2): 149, 2022 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-35075280

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10.

Thinking clearly about social aspects of infectious disease transmission.

Buckee, Caroline; Noor, Abdisalan; Sattenspiel, Lisa.

Nature ; 595(7866): 205-213, 2021 07.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34194045

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11.

A plant virus manipulates the long-winged morph of insect vectors.

Yu, Jinting; Zhao, Wan; Chen, Xiaofang; Lu, Hong; Xiao, Yan; Li, Qiong; Luo, Lan; Kang, Le; Cui, Feng.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 121(3): e2315341121, 2024 Jan 16.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38190519

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10801844
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2315341121

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12.

The probability of epidemic burnout in the stochastic SIR model with vital dynamics.

Parsons, Todd L; Bolker, Benjamin M; Dushoff, Jonathan; Earn, David J D.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 121(5): e2313708120, 2024 Jan 30.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38277438

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10835029
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2313708120

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13.

A simplicial epidemic model for COVID-19 spread analysis.

Chen, Yuzhou; Gel, Yulia R; Marathe, Madhav V; Poor, H Vincent.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 121(1): e2313171120, 2024 Jan 02.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38147553

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10769830
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2313171120

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14.

Meningococcal ACWYX Conjugate Vaccine in 2-to-29-Year-Olds in Mali and Gambia.

Haidara, Fadima C; Umesi, Ama; Sow, Samba O; Ochoge, Magnus; Diallo, Fatoumata; Imam, Abdulazeez; Traore, Youssouf; Affleck, Lucy; Doumbia, Moussa F; Daffeh, Bubacarr; Kodio, Mamoudou; Wariri, Oghenebrume; Traoré, Awa; Jallow, Edrissa; Kampmann, Beate; Kapse, Dhananjay; Kulkarni, Prasad S; Mallya, Asha; Goel, Sunil; Sharma, Pankaj; Sarma, Annamraju D; Avalaskar, Nikhil; LaForce, F Marc; Alderson, Mark R; Naficy, Abdi; Lamola, Steve; Tang, Yuxiao; Martellet, Lionel; Hosken, Nancy; Simeonidis, Evangelos; Welsch, Jo Anne; Tapia, Milagritos D; Clarke, Ed.

N Engl J Med ; 388(21): 1942-1955, 2023 May 25.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37224196

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10627475
https://dx.doi.org/10.1056/NEJMoa2214924

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15.

Local-scale phylodynamics reveal differential community impact of SARS-CoV-2 in a metropolitan US county.

Paredes, Miguel I; Perofsky, Amanda C; Frisbie, Lauren; Moncla, Louise H; Roychoudhury, Pavitra; Xie, Hong; Bakhash, Shah A Mohamed; Kong, Kevin; Arnould, Isabel; Nguyen, Tien V; Wendm, Seffir T; Hajian, Pooneh; Ellis, Sean; Mathias, Patrick C; Greninger, Alexander L; Starita, Lea M; Frazar, Chris D; Ryke, Erica; Zhong, Weizhi; Gamboa, Luis; Threlkeld, Machiko; Lee, Jover; Stone, Jeremy; McDermot, Evan; Truong, Melissa; Shendure, Jay; Oltean, Hanna N; Viboud, Cécile; Chu, Helen; Müller, Nicola F; Bedford, Trevor.

PLoS Pathog ; 20(3): e1012117, 2024 Mar.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38530853

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10997136
https://dx.doi.org/10.1371/journal.ppat.1012117

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16.

The impact of threshold decision mechanisms of collective behavior on disease spread.

Morsky, Bryce; Magpantay, Felicia; Day, Troy; Akçay, Erol.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(19): e2221479120, 2023 05 09.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37126702

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10175758
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2221479120

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17.

Wild animals suppress the spread of socially transmitted misinformation.

Fahimipour, Ashkaan K; Gil, Michael A; Celis, Maria Rosa; Hein, Gabriel F; Martin, Benjamin T; Hein, Andrew M.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(14): e2215428120, 2023 04 04.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36976767

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10083541
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2215428120

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18.

Inferring the differences in incubation-period and generation-interval distributions of the Delta and Omicron variants of SARS-CoV-2.

Park, Sang Woo; Sun, Kaiyuan; Abbott, Sam; Sender, Ron; Bar-On, Yinon M; Weitz, Joshua S; Funk, Sebastian; Grenfell, Bryan T; Backer, Jantien A; Wallinga, Jacco; Viboud, Cecile; Dushoff, Jonathan.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(22): e2221887120, 2023 05 30.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37216529

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10235974
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2221887120

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19.

Spreading processes with mutations over multilayer networks.

Sood, Mansi; Sridhar, Anirudh; Eletreby, Rashad; Wu, Chai Wah; Levin, Simon A; Yagan, Osman; Poor, H Vincent.

Proc Natl Acad Sci U S A ; 120(24): e2302245120, 2023 Jun 13.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-37289806

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10268263
https://dx.doi.org/10.1073/pnas.2302245120

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20.

Enhanced mosquito vectorial capacity underlies the Cape Verde Zika epidemic.

Rose, Noah H; Dabo, Stéphanie; da Veiga Leal, Silvânia; Sylla, Massamba; Diagne, Cheikh T; Faye, Oumar; Faye, Ousmane; Sall, Amadou A; McBride, Carolyn S; Lambrechts, Louis.

PLoS Biol ; 20(10): e3001864, 2022 10.

Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-36288328

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9604947
https://dx.doi.org/10.1371/journal.pbio.3001864

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